低迷的经济、高科技的犯罪、充满暴力的人群，残酷的现实让人们的生活与不安紧紧地连在了一起，就连外太空的宇宙工场也不例外。真人尸体、机械躯体碎片四处横飞，工场内一片血腥。面对即将被大气层焚毁的危急时刻，孤立无援的攻壳机动队员们能否安全重返地球，还是个未知数……
外太空上的宇宙工场专门在失重状况下制造精密仪器和科学研究，由于不明原因，宇宙工场发生暴动，与电脑都市中枢——新港市政府失去联络。
攻壳机动队员们接到命令——到宇宙工场进行国际救援，将全部工场员工偷偷接回地球。队员巴特、军方特工也同行参与。此时素子的身体，因为长期的机械化和空气效应而渴望休息，不得不拖着疲倦的躯体开始新的任务。
形势危急，宇宙工场MJ2因为失去重力，正在向地球坠落，距离被大气层焚毁仅有几个小时。工场内部一片血腥，真人尸体、机械躯体碎片在失重情况下四处横飞，血雾弥漫，视线极端模糊，空气污浊，缺乏动力设备。少数幸存者只依靠仅维持4个小时生命状态的宇航服生存。一个没有任何官方记录的仿生人MAX利用宇宙工场MJ2的能量和智慧成为实体，因为没有正确的教育指导而成为容易激怒的杀人工具。MAX穿著强化服以残忍手撕方法杀害工场员工。而该仿生人的指挥才能DNA提供者，正是随行而来的军方特工。政府隐瞒军方暗地组织特工制造作战指挥官的事实，并且不提供任何后备支援力量。国家安全力量支柱、反恐部队——攻壳机动队孤军奋战：既要应对超强杀伤能力、超强作战智慧的仿生人，又要完成安全对接宇宙空间站获取返回地球能源的任务。
危急关头，素子的敏锐、机智和作为女性人类的直觉，再次在这个空旷无人的空间得到发挥。工场负责人必须接受心脏移植手术，否则濒临死亡；必须完成空间站对接，否则将被大气层毁灭；对接只有一次机会，否则会因为冲撞力量提前坠毁。素子毅然将工场负责人的妻子——巴特心爱的女子送入宇宙空间站，自己却留在即将被大气层焚毁的宇宙工场，依靠2个聪明机智的弗奇科马完成手术。倒数秒的声音中，弗奇科马和仿生人MAX用长长的链锁将两人送回空间站。空无一物，载满机密和碎片的宇宙工场MJ2陨落了，而MAX则带着弗奇科马的存储记忆，带着对人类的向往，在浩瀚的太空中流浪，渐行渐远……
面对又一例自我意识觉醒导致交流、自由障碍的仿生人事件，素子的情感发生失衡：仿生人值得同情么？当人和人，人和机械设备依靠插在脖子上的电缆交流的时候，人和机械区别在哪里？
