《搜神记》内容十分丰富，有谶纬神学、有神仙变幻，有精灵物怪，有妖祥卜梦，还有人神、人鬼的交通恋爱等。其中保留了相当一部分西汉传下来的历史神话传说和魏晋时期的民间故事，优美动人，深受人们喜爱。如卷十四的“盘瓠神话”，是关于古时蛮族始祖起源的猜测、“蚕马神话”是有关蚕丝生产的神话；如卷十一“干将莫邪”讲述的复仇故事、卷十六紫玉传说，讲吴王小女的生死爱情；卷十一“东海孝妇”，讲孝妇周青蒙冤的故事、韩凭夫妇的传说则歌颂了忠贞不渝的爱情、卷一仙女下嫁董永的故事也是如此。 这些故事是《搜神记》的精华所在，历代长传而不衰。
《搜神记》对后世影响深远，如唐代传奇故事，蒲松龄的《聊斋志异》，神话戏《天仙配》及后世的许多小说、戏曲，都和它有着密切相关的联系。后有托名陶潜的《搜神后记》10卷和宋代章炳文的《搜神秘览》上下卷，都是《搜神记》的仿制品。
