我的奶奶是他爷爷的亲妹妹

这个情况属于近亲的，近亲结婚是指三代及三代以内有共同的祖先，所以你的奶奶和她的爷爷是有共同的祖先，所以这个是绝对不能结婚的，如果结婚了，将来生下的孩子很容易发生各种遗传性疾病，所以对身体的影响是存在的，需要注意的，建议重新找到合适的对象，避免将来生下不健康的孩子，所以在平时需要注意的。