说文解字中是如何把全部字归入540部的？有没有什么规律？

有规律啊。9353个字分别部居归入540部首。这种规律首先体现为：540部首的排列是有规律的，“始一终亥”。比如部首“一、上、示、三、王、玉、珏、气、士、丨-----”一般来说，前后的部首之间在字形上有相似性，这是最重要的一条规律。