7月22日,Deepmind在《自然》杂志发表文章称,AlphaFold已经预测出了35万种蛋白质结构,涵盖了98.5%的人类蛋白质组以及20种生物的蛋白质,并开源了它的数据库。前基因泰克CEO Arthur D. Levinson称这一成就为“划时代的进步”。
这期我们请到了一位生物学的大牛史寒朵来全面解析AlphaFold的真实价值在哪里?AlphaFold如果要用于疾病治疗与制药,还需要哪些进展?我们尝试尽可能通俗的解读AlphaFold的真实意义。
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【主播】
泓君,《硅谷101》主持人
【嘉宾】
史寒朵,斯坦福大学生物学博士后
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【你将听到】
【03:56】为什么研究蛋白质结构难且重要
【06:35】如果AlphaFold早点开源,我的研究项目可以早一年做完
【11:10】 为什么我们需要用AI计算来解蛋白质结构
【15:20】从18年到今年,AlphaFold的两次升级更新了什么
【17:50】AlphaFold加速科研进展,但离药物研发还有距离
【23:57】结构生物学家:AlphaFold偏偏没有解出我要的那个蛋白
【27:35】硅基科学与碳基科学开始融合,跨学科沟通闹笑话
【35:55】AlphaFold还不能取代冷冻电镜,要同时研究小分子结构才更有价值
【38:40】南湾近两年出现上百家创业公司,生物领域现突破性创新
【42:50】吃屎能变瘦吗?肠道菌群应用广
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【BGM】
Jazz in Paris - Radio Night
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【创作团队】
主理人|泓君
后期|穆正东
文字运营|王晶
原创插画|Zikki
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听友273908336
灌肠就行。吃屎不管用
耍泥巴
用显微镜看蛋白质结构。。。。。。。。科学基础教育很重要
泓君Jane 回复 @耍泥巴:
尴尬了😅
Zac007
质量一如既然的💯
NirVanaYC
嘉宾,主持人都好厉害!!
昵称有人用怎么办
这期相当不专业,很多概念个数字都是错的
泓君Jane 回复 @昵称有人用怎么办:
哪儿是错的?欢迎指教指出来哇
泓君Jane 回复 @昵称有人用怎么办:
感谢!这种细节的讨论特别好,98.5%更清晰的解释了概念,后面的部分嘉宾还想注册个账号跟你讨论呢
昵称有人用怎么办 回复 @昵称有人用怎么办:
第一,98.5%是计算了的蛋白结构比例,不是说这么多蛋白都是准确预测,其中能算是准确预测的大概一半比例,当然不同打分矩阵结果不一样。第二,casp的评分标准都是一样的,一代和二代差别就是算法和msa数据的差别,casp比赛的蛋白也不是结构复杂的蛋白。alphafold算法没看到有生物物理知识输入,不晓得指什么