五岁的宗介住在山崖上的房子里，在海边，他意外地捡到了一条被困在玻璃瓶里的小红鱼，并给它取名波妞，波妞是海洋之母的女儿，波妞的父亲，魔法师，藤本，认为人类的世界肮脏丑陋，强行将出逃的波妞带回了深海，勇敢的波妞，带领妹妹们迎风踏浪，寻找宗介，而承诺要永远保护波妞的宗介，也将迎来许多挑战。
