漫画：推理漫画：连环漫画

D

解析：

第一步：判断题干词语间逻辑关系。

推理漫画和连环漫画都是漫画的一种，为包容关系中的种属关系，且推理漫画和连环漫画为交叉关系。

第二步：判断选项词语间逻辑关系。

A项：对流层和中间层都是大气的组成部分，为并列关系，且对流层和中间层为并列关系中的反对关系，与题干逻辑关系不一致，排除；

B项：阳离子和阴离子都是离子的一种，为包容关系中的种属关系，且阳离子和阴离子为并列关系中的矛盾关系，与题干逻辑关系不一致，排除；

C项：红光和紫光都是可见光的一种，为包容关系中的种属关系，且红光和紫光为并列关系中的反对关系，与题干逻辑关系不一致，排除；

D项：馆藏文物和史前文物都是文物的一种，为包容关系中的种属关系，且馆藏文物和史前文物为交叉关系，与题干逻辑关系一致，当选。

故正确答案为D。