金庸小说里面最强的武功是独孤九剑吗

很确定的说，不是，甚至在独孤求败手中都不是最强的武功。
独孤求败的剑境有三层，《独孤九剑》只是他利剑时期的武学，论起境界和造诣还不如重剑时期（重剑无锋，大巧不工），和无剑时期（草木竹石皆可为剑）更是不能比。《独孤九剑》强在全面，里面包含了许多独孤求败总结的对敌经验。