她说:在吗？ 不好意思，我昨晚睡着了。 怎么回复她？

这句话没有需要你回复的意思，她还会再给你打电话，等

在，没事，我猜到你睡着了所以没继续发信息/打电话给你了

这个问题难道都很难回复吗？
如果你和这个女生是相互暧昧的关系，这个时候他主动回复你消息了，如果你当他有什么事情，或者有什么话想对他说，恰恰就是这个时候是最好的机会。比如说昨天晚上你想找他说一说一些事情，或者约他今天出去干什么事情，你这个时候就可以给他说清楚。
但如果你和这个女生仅仅是普通朋友关系，既然是这样的话，你可以回复一句，哦，没什么事，只是随便聊聊，如果你睡着了也没有什么事。
无论怎么样，既然人家是这么回复你的，也只有相信他昨晚上的的确确是睡着了，即便是他是真的睡着了，还是有其他事情耽搁了，没有及时回复你的信息。