据考证，石窟群距今至少有1700年的历史。关于它的来历和作用，目前共有十几种说法，其中有：石窟屯兵说；徽商屯盐说；采石场说；皇陵说；功能转化说；方腊洞说。 在这其中占主流的说法主要有两种：一种认为这里曾做屯兵时的驻地和弹药库之用。《新安志》上记载：“东汉时期，孙权为削平黟、歙等地，派大将贺齐屯兵于溪水之上，后改新安江上游水域为“屯溪”。这既解释了“屯溪”地名的由来，也为石窟群提供了一种答案。
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