人有两套生命系统：一套是灵魂生命系统，即阳；一套是肉体生命系统，即阴。整部《黄帝内经》概括起来就一句话：一个核心，两个基本关系。一个核心是指：中医是以灵魂为核心的医学，而不是以解剖生理系统为核心的医学。两个基本关系是指：灵魂与肉体的关系、灵魂与宇宙精气的关系。
《易经》与《黄帝内经》的关系：《易经》是人有两套生命系统的符号表达形式，《黄帝内经》是这套符号系统的理论解释与实际应用。
早期的人类并没有“我”这个概念，灵魂可以直接控制“假体”，所有的人都是“灵我”。但随着时间的推移，“假体”的自我开始觉醒，开始反抗灵魂的控制。文字发明以后，标志着“物我”彻底独立，一个新物种诞生了，那就是人类。
人类的大脑本来不会产生“形而上”的大智慧，只会产生同级动物的“生存之思”。人类借助大脑反射的灵魂智慧，构建起了自己的文明体系，用逻辑、定理、定律、概念等为砖头，砌起了一堵高墙，隔绝灵魂与“物我”的联系，借以摆脱灵魂的控制，保持自我独立。但这种独立是虚假的，人类始终是个灵魂影响下的半成品。
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