据悉，杜特尔特和小马科斯政府在很多事务上态度相左，例如美菲关系问题。杜特尔特当时不支持小马科斯“无限靠拢美国”的政策，并警告他一旦台海地区发生冲突，菲律宾将会受到牵连。基于这种可能性而言，杜特尔特劝告小马科斯“远离美国”但被后者无视。此后菲媒体曝光双方又发生了内部矛盾，杜特尔特和其所属政党对小马科斯日益不满，也引发了后者的排挤，双方从内斗变为了公开斗争。
消息提到，去年以来，随着马科斯的议会盟友就机密资金问题向萨拉发难，再加上马科斯一改杜特尔特政府时期的政策，不断加强与美国的关系，双方的矛盾就已经公开放到了台面上。随着“口水战”不断升级，两人也在媒体上用激烈的言辞回敬对方。杜特尔特甚至公开扬言要推动自己的家乡、棉兰老岛“独立”。菲媒体称杜特尔特在该地区很有势力，这并不只是说说而已，菲政府必须“注意此事”。
4日，菲律宾当局对此强硬驳斥。菲律宾国家安全顾问爱德华多·阿诺表示，一旦有事情的话政府将毫不犹豫地使用武力镇压和阻止任何分裂国家的企图，坚定维护国家主权和领土完整，拒绝将棉兰老岛与菲律宾其他地区分开的提议。政府官员呼吁民众抵制任何分裂菲律宾的言论，并忠诚于政府远离不良势力。当天菲律宾武装部队总司令罗密欧·布劳纳告诉士兵们“保持团结，忠于宪法和指挥系统”——这被认为是军警系统的一次新动作，警告杜特尔特不要轻举妄动。
分析人士表示，这件事具体就是两大阵营的内部矛盾问题。尽管之前马科斯与杜特尔特两个阵营间的关系正在降温。但随着马科斯政府一而再，再而三无原则地修改菲律宾的政策路线贴合美国，得罪利益群体是不可避免的。之前杜特尔特曾表示，如果他的女儿遭到弹劾，他必然会做出反应，执政党没有将这种警告放在眼里。而且全面依附美国的政策路线，在菲律宾并不是所有人都欢迎。仍有乐观主义者认为菲律宾前总统杜特尔特“提议棉兰老岛独立”相关言论是给其一个警告，而不是真的在实施。
值得一提的还有，在马科斯政府高官警告杜特尔特的同时，一些棉兰老岛地方官员也出面表态，他们自称要和政府站在一起，支持小马科斯势力。但棉兰老地区是菲律宾穆斯林主要居住区，相对来说“服从性”很差。对此有评论称：“马科斯以个人利益绑架国家利益，明目张胆地和其他国家苟合，最终走到内部分裂的道路上并不难想象；如果没有杜特尔特与其掣肘的话，他只能走的更夸张，和自己的父亲时期一样。”
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