每一集讲的都是坏人通过各种方法混进来偷蓝水晶的。。那部动画叫什么来着？？

应该是根据凡尔纳的巨著《海底两万里》和《神秘岛》改编的39集动画片《蓝宝石之谜》，或者译作《不可思议的海之娜蒂亚》。

主角少女名叫Nadia。西历1889年，巴黎的街角，Jean与Nadia相遇了，故事由此展开……在万国博览会会场喜欢发明的少年Jean和马戏团的少女Nadia偶然相遇了。这时以Nadia胸前所佩的谜之蓝宝石为目标的格兰蒂斯一伙登场了。在格兰蒂斯一伙的追击中Jean与Nadia出乎意外的冒险旅程开始了。