三剑奇缘最后结局是怎么样的娜娜跟史天云在一起了吗？

是的。
大结局：
次日交手中，白琼跳下山崖。镜主跟着跳下，想救白琼。波娜娜也跟着跳了下去，史天云紧随其后，要救自己的波娜娜。镜主抱住白琼，承诺说一定会照顾她生生世世，把波娜娜给史天云，自己则一直落到崖底，一命呜呼。
娜娜和史天云站在崖边，久久地沉默着。