主治医师考试第一年过两门，第二年补考过一门，第三年是补考三门吗？

主治医师考试第一年过两门，第二年补考过一门，第三年需要再考三门。
主治医师资格考试，即为取得主治医师资格证书的考试。科目分为：“基础知识”、“相关专业知识”、“专业知识”、“专业实践能力”等4个科目。考试成绩在各科目中以100为满分计算，每科目成绩达到60分为合格，考试成绩有效期为2年。所有4个科目在2年内全部合格者可申请该级专业技术资格。

主治医师的成绩有效期是两年，今年要考去年没通过的科目，所以第三年考剩下的三门。

可以的，主治医师的成绩是两年滚动制，连续两年通过4门考试就可以。如果你第三年和第二年，连续两年通过了全部4门课程，就算合格了。