新型冠状病毒肺炎疫情还在持续。传染病防治本是政府的重要职责，保障传染病防治经费以及进一步改善公共卫生事业，为人民群众的健康和生命安全提供财力支持，国家财政义不容辞。
财力相对于需求而言，总是处于稀缺状态。在这个时候，如果防治新肺炎需要的更多财力投入，就必须适当调整财政支出结构。预算支出安排依重要性而列，在当前经济社会环境中，没有比抗击新肺炎更重要的事。
没有无源之水，没有无本之木。财政投入必须要有来源。财政学原理不会过时，只是在资源配置的时间选择上必须进行优化。延长春节假期肯定会有短期经济损失，却是必要的选择。全国已延长三天假期，可大大减少病毒的传播。
2019年一些地方财政困难已经显现，受新肺炎疫情冲击，不少本应开展的经济活动已经停下来，仅仅依靠这些地方自身，恐怕会有困难。这样，或增加中央对地方财政的转移支付力度，或扩大地方财政赤字规模，以保证地方公共服务的正常提供。2020年财政赤字应该考虑超过3%。只要未来经济增长可持续，财政赤字风险就完全在可控范围之内。
人们很自然地将新肺炎疫情与2003年的非典进行比较。2003年中国经济增长并没有因为非典冲击而下行。2002年GDP增长率为9.1%，2003年为10%。而且，2004年、2005年继续保持更快的增速，分别为10.1%和11.4%。这就是说，只要采取有效措施，新冠肺炎在短期内所造成的经济损失，完全有可能通过疫情之后的努力得到弥补。我们应该要有这个信心。当然，新肺炎疫情与非典的影响面、影响程度都有差异，简单地进行比较是远远不够的。但2020年中国经济实力比2003年有根本性的变化，应对风险的经济实力已有质的变化。
应对新肺炎疫情，需要与全面财政改革更加有机地结合起来。2003年抗击非典，让我们明白了公共卫生事业发展的重要性。这些年来，随着国家财政实力的增强，财政在公共卫生事业的投入持续增加，公共卫生服务短板已经得到较多的弥补。但现在看来，还需要做得更多。按照治理现代化目标的要求，需要进一步改进财政支出效率，将财政投入与公共卫生服务水平的提高更有机地结合起来。
公共卫生事业的发展有其规律，如何协调财政管理和公共卫生事业发展的专业管理之间的关系，仍将是未来财政投入需要面对的挑战。仅仅科研攻关，就可能有不同路径。卫生科研经费的配置，是一个难题。公共卫生事业财政投入的重点在哪个环节，城乡以及不同地区的财政经费配置，也有许多工作要做。一个现代化的国家，必须讲究财政资金投入的效率，卫生领域的预算绩效问题必须找到更有效的解决办法。
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