1、行为人已经着手实施本罪的准备行为，由于意志以外的原因未得逞的，成立本罪的未遂犯。
2、为了实施本罪而实施的准备行为（预备罪的预备行为），如果具有危害公共安全的抽象危险，也可能（不是必然）适用刑法总则关于预备犯的规定。
【例1】A为了组织恐怖活动培训，已经联系了讲授人员与参加人员，或者准备了培训场所的，应按照《刑法》第22条的规定，以预备犯（从属预备罪）处罚。
【例2】B为他人实施恐怖活动而实施本罪的准备行为的，也能成立本罪。但是如果他人根本不实施恐怖活动犯罪的，则对实施准备行为的人不能以本罪论处。
3、实施本罪行为同时构成其他犯罪的，应依照处罚较重的规定定罪处罚，此系想象竞合犯。
【例3】为实施恐怖活动准备危险物品，同时构成本罪与非法储存爆炸物罪的正犯时，应认定为想象竞合，从一重处罚。
【例4】甲、乙等人为实施大规模杀人的恐怖活动进行了策划，准备了大量危险凶器，并对参训人员进行了培训，应认定为本罪与故意杀人罪（预备）的想象竞合，从一重处罚。
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